成本分摊协议管理的步骤主要包括以下几个方面：

1. 确定分摊对象：确定需要进行成本分摊的具体项目或活动，例如研发项目、市场推广活动等。

2. 制定成本分摊协议：制定成本分摊协议，明确分摊的原则、方法、比例等，确保分摊过程的公平、合理。

3. 收集相关数据：收集与分摊对象相关的成本数据，包括直接成本和间接成本，例如人工成本、材料成本、设备折旧等。

4. 计算分摊比例：根据成本分摊协议中规定的分摊方法，计算各参与方的分摊比例。分摊比例可以按照人力投入、资源使用量、销售额等进行确定。

5. 分摊成本：根据分摊比例，将相关成本按照协议规定的方法进行分摊，确保各参与方按照约定承担相应的成本。

6. 监督和管理：对成本分摊过程进行监督和管理，确保各参与方按照协议履行义务，及时调整分摊比例或方法，解决可能出现的问题。

7. 记账和报告：根据成本分摊协议，将分摊后的成本进行记账，并在财务报表中进行披露，以便监管机构和利益相关方了解成本分摊情况。

需要注意的是，成本分摊协议管理的具体步骤可能会因不同的情况而有所差异，以上仅为一般性的步骤参考。在实际操作中，还应根据具体情况进行具体分析和处理。